Родился в 1895 г. Место рождения: Эстония, г. Пернова.
Эстонец.
Род деятельности к моменту ареста - "наборщик типографии".
Был бывший член ВКП(б), исключен за уклонение от партучета.
Последний раз Эдуард Янович Аперсон был арестован 10 февраля 1938 г.
Приговор вынесен тройкой при УНКВД СССР Московской обл. 27 февраля 1938 г. Был расстрелян 8 марта 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 27 января 1960 г. за отсутствием состава преступления.