Родился в 1892 г. Место рождения: Моск. обл., Серпуховский р-н, д. Шатово.
Русский.
Род деятельности к моменту ареста - "строительная контора №8 при фабрике им. Ногина: десятник".
Был беспартийным.
Последний раз Прохор Михайлович Агафонов был арестован 25 февраля 1938 г.
Приговор вынесен Комиссией НКВД и Прокуратурой СССР 29 июля 1938 г. Был расстрелян 27 августа 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 7 декaбря 1958 г. за отсутствием состава преступления.