Родился в 1895 г. Место рождения: Одесская обл., г. Ананьева.
Русский.
Получил среднее образование.
Род деятельности к моменту ареста - "3-я контора треста уличной очистки Моссовета: бухгалтер". Был беспартийным.Последний раз Анатолий Иванович Бабенко был арестован 17 марта 1937 г.
Приговор вынесен тройкой при УНКВД СССР по Московской обл. 26 июня 1938 г. Был расстрелян 4 июля 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 20 августа 1956 г. за отсутствием состава преступления.