Родился в 1899 г. Место рождения: г. Курск.
Русский.
Род деятельности к моменту ареста - "слесарь вагоноремонтного пункта ж.-д. ст. Курск.".
Был беспартийным.
Последний раз Агафон Федорович Болдырев был арестован 24 февраля 1938 г.
Приговор вынесен тройкой при УНКВД СССР по Московской обл. 27 февраля 1938 г. Был расстрелян 8 марта 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 18 апреля 1958 г. за отсутствием состава преступления.