Родился в 1887 г. Место рождения: Латвия, г. Рига.
Получил среднее образование.
Род деятельности к моменту ареста - "з-д 'Главмясо': зав. отд. по технике безопасности". Был бывший член ВКП(б).Последний раз Ян Эрнестович Вильсон был арестован 15 февраля 1938 г.
Приговор вынесен Комиссией НКВД и Прокуратурой СССР 20 февраля 1938 г. Был расстрелян 14 апреля 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 28 апреля 1989 г. за отсутствием состава преступления.