Родился в 1885 г. Место рождения: Лифляндская губ., Венденский уезд, усадьбы Лиды.
Получил высшее образование.
Род деятельности к моменту ареста - "без определенных занятий". Был беспартийным.Последний раз Ян Янович Калнин был арестован 15 декaбря 1937 г.
Приговор вынесен Комиссией НКВД и Прокуратурой СССР 30 апреля 1938 г. Был расстрелян 17 мая 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 20 октября 1958 г. за отсутствием состава преступления.