Родился в 1902 г. Место рождения: с. Орловка Холмского р-на Черниговской обл.
Украинец.
Получил среднее образование.
Род деятельности к моменту ареста - "письмоносец с. Очаково (священник украинской автокефальной церкви, председатель общины баптистов-евангелистов).". Был беспартийным.Последний раз Прокофий Иванович Полегенько был арестован 4 сентября 1937 г.
Приговор вынесен тройкой при УНКВД СССР по Московской обл. 22 сентября 1937 г. Был расстрелян 23 сентября 1937 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 19 июля 1989 г. за отсутствием состава преступления.