Родился в 1875 г. Место рождения: Томская губ., г. Колывань.
Последний раз Степан Иванович Сафонов был арестован 10 марта 1938 г.
Приговор вынесен Комиссией НКВД и Прокуратуры СССР 17 мая 1938 г. Был расстрелян 28 мая 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 29 октября 1957 г. за отсутствием состава преступления.