Родился в 1893 г. Место рождения: Западная обл., Монастырщенский р-н, дер. Тихоновка.
Русский.
Получил среднее образование.
Род деятельности к моменту ареста - "Контора сельхозснабжения: заведующий плановым сектором". Был беспартийным.Последний раз Евдоким Афанасьевич Малышев был арестован 26 октября 1937 г.
Приговор вынесен Тройкой при УНКВД СССР по Московской обл. 19 ноября 1937 г. Суть обвинения: в систематической антисоветской контрреволюционной агитации и пропаганде. Был расстрелян 21 ноября 1937 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 31 января 1990 г. за отсутствием состава преступления.