Родился в 1873 г. Место рождения: Владимирская губ., д. Истешево.
Русский.
Род деятельности к моменту ареста - "стекольщик завода 'Штамп'. Монархист-церковник, связан с монашествующими".
Был беспартийным.
Последний раз Семен Агапович Щербаков был арестован 1 сентября 1937 г.
Приговор вынесен Тройкой при УНКВД СССР по МО 25 сентября 1937 г. Суть обвинения: Обвинен в контрреволюционной агитации.. Был расстрелян 17 октября 1937 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 30 июня 1937 г. за отсутствием состава преступления.