Родился в 1878 г. Место рождения: Латвия, Лифляндская губ., Вольмарский уезд, пос. Руен.
Латыш.
Получил высшее образование.
Род деятельности к моменту ареста - "Ликвидком Гос. конторы Агротехзнания Наркомзема РСФСР: председатель". Был член ВКП(б).Последний раз Емельян Яковлевич Аболтин был арестован 28 февраля 1938 г.
Приговор вынесен Комиссией НКВД и Прокуратурой СССР 31 мая 1938 г. Был расстрелян 14 июня 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 11 августа 1956 г. за отсутствием состава преступления.